Lüganusen kirkko on vanhan kirkkopitäjän (kihelkonna) keskus, johon nykyisin kuuluvat Kiviöli ja Sonda. Kirkko on alkujaan 1300-luvulta. Elokuussa 1941 kirkko paloi pahoin ja saatiin uudelleen käyttöön vasta vuosikymmen myöhemmin. Se sai tuolloin urut (Kriisa) suljetusta Rakveren Paavalin (Pauluse) kirkosta.

1700-luvun lopussa seurakunnan pappina oli Otto Masing, jonka sanotaan luoneen viron kirjakieleen õ-äänteen.